Caracterización genética de la raza bovina de lidia mexicana

Resumen

El ganado de la raza de Lidia ha sido seleccionado durante siglos por caracteres relacionados al comportamiento, una peculiaridad que la distingue del resto de las razas vacunas, principalmente seleccionadas por características de interés productivo, como carne y leche. En España, la población de Lidia originaria ha sido estudiada por medio de información genómica, permitiendo conocer que la riqueza genética de ésta raza se debe al aporte proporcionado por cada uno de los múltiples encastes o linajes en los que se subdivide. En México la raza de Lidia representa un legado histórico y cultural importante y actualmente, su población no ha sido caracterizada genéticamente. En esta tesis analizamos la diversidad y estructura genética de la población Mexicana y la comparamos con información proveniente de la población originaria Española utilizando información genómica mediante diferentes tipos de marcadores moleculares. Primero analizamos los parámetros de diversidad genética en ambas poblaciones con marcadores autosómicos de tipo Microsatélite y Polimorfismos de nucleótido único, encontrando valores similares de heterocigosis esperada con ambos tipos de marcadores moleculares. Encontramos también valores elevados en términos de FIS en ambas poblaciones. Tanto los valores elevados de FIS en los encastes así como el comportamiento que presentan las Carreras de Homocigosis son consecuencia del bajo censo de los encastes, contribuyendo por ende a incrementar la tasa de endogamia. También encontramos una alta diferenciación genética entre poblaciones con ambos tipos marcadores moleculares; microsatélites y SNPs. La partición de la variabilidad genética total analizada con SNPs mostró que el 19% de la variación se explica por las diferencias genéticas entre linajes. Curiosamente, la estructura genética de la población mexicana reveló que comparte escasos orígenes genéticos en común con la población originaria española, ubicando a ambas poblaciones en grupos diferentes. El análisis de cromosoma Y mostró que la Casta Navarra ha dejado huella paterna en la población mexicana mediante una frecuencia elevada en el haplotipo H6, exclusivo de ésta casta así como del encaste de Miura. Los análisis de ADN mitocondrial, por otro lado, revelaron patrones de haplotipos similares en ambas poblaciones. Por último, considerando la peculiaridad en la selección de esta raza, realizamos un análisis para detectar huellas de selección que pudieran afectar caracteres asociados a comportamiento de tipo agonista, utilizando dos razas mansas españolas como referencia. Utilizando dos métodos que se basan en inferencias bayesianas, identificamos en común dos regiones genómicas seleccionadas. A demás, la dirección e intensidad en la frecuencia del alelo seleccionado en la raza de Lidia es opuesto a los de las razas mansas. En éstas regiones detectamos genes asociados a rutas metabólicas como las de la serotonina y la dopamina, así como genes expresados en corteza cerebral, los cuáles han sido relacionados con patrones de comportamiento agresivo en humanos y animales de laboratorio.