Secuenciación masiva en fallos medulares congénitos

Resumen

Introducción: Los síndromes de fallo medular congénito (SFMC) son un grupo heterogéneo de enfermedades de base genética que se caracterizan por tener un gran solapamiento fenotípico, lo que hace que el diagnóstico basado en la presentación clínica es muy complejo. La caracterización molecular es esencial para dar el diagnóstico definitivo, administrar el tratamiento más adecuado y establecer el pronóstico. Las herramientas de secuenciación masiva parecen ofrecer una plataforma útil para definir genéticamente las enfermedades con alta heterogeneidad genética como son los SFMC. Objetivos: -Analizar el rendimiento del panel de secuenciación masiva diseñado para pacientes con sospecha de fallo medular congénito. -Analizar la capacidad diagnóstica del panel de secuenciación masiva en todos los pacientes con sospecha de fallo medular congénito incluidos en el estudio. -Analizar si la capacidad diagnóstica del panel NGS difiere entre los distintos grupos clínicos de este estudio. -Desarrollar una estrategia de estudio que incluya técnicas de secuenciación masiva para el diagnóstico molecular de los SFMC. Metodología: Se ha diseñado un panel NGS de 128 genes asociados al desarrollo de fallo medular congénito (FMC). Se han obtenido 130 muestras de pacientes que han sido secuenciadas y analizadas por el equipo bioinformático en el instituto de genética médica y molecular (INGEMM) del Hospital La Paz. Para la secuenciación se ha utilizado la plataforma NextSeq (Illumina Roche). El análisis bioinformático ha sido orientado a la identificación de mutaciones puntuales y deleciones e inserciones de pequeños fragmentos de ADN. Resultados: De las 130 muestras procesadas, 5 no fueron aptas para el análisis y 10 se incluyeron como controles positivos. Finalmente se estudiaron un total de 115 muestras sin diagnóstico molecular previo. En el 44% (51/115) se detectaron mutaciones asociadas a la enfermedad del paciente. Del total de muestras analizadas, el 75% (86/115) fueron incluidas en el grupo FMD, obteniéndose un ratio diagnóstico del 51% (44/86). EL 25% restante se incluyeron en el grupo FMI, encontrándose mutación causal en el 24% de los pacientes (7/29). Conclusiones: las técnicas NGS son una opción útil para el diagnóstico de pacientes con FMC. En nuestra serie, hemos alcanzado una tasa diagnóstica del 44%, coincidiendo con lo descrito en la literatura. Sigue existiendo un porcentaje de pacientes sin diagnóstico genético, que parece ser más evidente en el grupo FMI, lo que sugiere que la capacidad diagnóstica de estas técnicas difieren entre los diferentes fenotipos estudiados.