Estudios moleculares del sistema regulador de la degradación anaeróbica de benzoato en Azoarcus sp. CIB

Resumen

A continuación se exponen las conclusiones extraídas a lo largo de este trabajo: 1. Se ha caracterizado la regulación sobreimpuesta mediada por oxígeno del cluster bzd implicado en la degradación anaeróbica de benzoato en Azoarcus sp. CIB. La actividad del promotor catabólico PN es estrictamente dependiente de la ausencia de oxígeno y requiere una proteína activadora, e. g., Fnr de E. coli, que se une a una región operadora centrada en la posición -42.5, indicando que se trata de un promotor de clase II. 2. La proteína Fnr está implicada tanto en el reclutamiento de la RNAP en el promotor PN como en la formación del complejo abierto en el inicio de la transcripción. 3. Se ha identificado un nuevo gen regulador, denominado acpR, en Azoarcus sp. CIB que codifica un homólogo de la proteína Fnr de E. coli, cuyo papel es crucial en la degradación anaeróbica de compuestos aromáticos ya que es imprescindible para la activación del promotor PN en ausencia de oxígeno. 4. Se ha caracterizado la regulación del gen bzdR, cuya expresión a partir del promotor PR está reprimida por la proteína BzdR y se activa débilmente en presencia del inductor benzoil-CoA. 5. La región operadora de la proteína BzdR en el promotor PR solapa con las cajas -10 y -35 de interacción con la RNAP, así como con el sitio de inicio de la transcripción (+1), lo que está de acuerdo con la función represora observada para esta proteína.