Desarrollo de herramientas moleculares para la producción de policétidos y péptidos no ribosomales

Abstract

Los ambientes marinos son una gran fuente de compuestos naturales. Muchas de estas moléculas son sintetizadas como mecanismo de defensa por microorganismos simbiontes de organismos marinos tales como esponjas, tunicados o poliquetos. Entre la gran variedad de productos naturales, cabe destacar la presencia de moléculas producidas por clústeres biosintéticos bacterianos que codifican policétido sintasas (PKS) y/o sintasas de péptidos no ribosomales (NRPS). La organización modular de este tipo de clústeres génicos, que en ocasiones pueden abarcar grandes regiones del genoma, permite la síntesis de compuestos con una gran variabilidad química. Existen diferencias en las herramientas utilizadas para identificar clústeres génicos que codifican PKSs y NRPSs, dependiendo de que se trate de un microorganismo cultivable o de un microbioma completo que incluye el microorganismo productor. En el caso de que se haya conseguido aislar y cultivar el microorganismo productor se pueden utilizar herramientas genómicas, como procedimientos de secuenciación masiva y su posterior análisis bioinformático, o bien la construcción de librerías genómicas en vectores de clonación de gran capacidad. Sin embargo, si se pretende identificar la secuencia de DNA de un clúster productor que pertenece a un microorganismo no cultivable, se pueden utilizar diferentes herramientas metagenómicas. Entre estas técnicas se encuentran la generación de librerías metagenómicas a partir de DNA metagenómico obtenido del microbioma y procesos de secuenciación masiva para su posterior análisis mediante herramientas bioinformáticas especializadas...