Estudios estructurales de procesos de auto-reconocimiento entre biomoléculas mediante RMN

Resumen

En esta tesis se realiza el estudio estructural por RMN de diferentes péptidos y oligonucleótidos sintéticos, sistemas que pueden revelar algunas claves sobre las bases moleculares en que se basa su capacidad de auto-ensamblaje. Fundamentalmente nos hemos centrado en los cuatro sistemas siguientes: * El péptido ABeta, uno de los principales protagonistas moleculares en el desarrollo de la enfermedad del Alzheimer. Este péptido forma fibras de amiloide in vivo en concentraciones nanomolares, in vitro, sin embargo, necesita concentraciones micromolares para iniciar dicha oligomerización. Esta diferencia podría sugerir un efecto de nucleación in vivo que facilite su oligomerización. Hay trabajos que sugieren que algunos gangliósidos podrían ser los responsables de dicha nucleación. Nuestro estudio trata de describir dicha interacción entre el péptido ABeta y el gangliósido GM1 por RMN. * Los péptidos KIA, una familia de péptidos de diseño con capacidad de tetramerizar con el plegamiento específico y de estabilidad similar al de una proteína natural. La descripción de la estructura que forman nos ha otorgado la posibilidad de demostrar que una estructura protéica puede ser formada en ausencia de puentes de hidrógeno terciarios, simplemente por el correcto empaquetamiento entre residuos hidrófobos. * Conjugados de oligonucleótidos y péptidos que generan la unión covalente entre las dos hebras que forman un dúplex de ADN a través de un puente disulfuro entre las cisteínas presentes en el péptido. Los diferentes nucleopéptidos estudiados nos desvelan algunas las claves sobre plagamiento de oligonucleótidos e interacción péptidos-ADN. * Guaninas modificadas con la introducción de un grupo amino en la posición 8, que al ser incorporadas en estructuras no canónicas de ADN (triplex y cuádruplex de diferente naturaleza) consiguen variar la estabilidad de dichas estructuras.