Aplicaciones del análisis clonal en patogenia y terapéutica de la infección por vih-1

Resumen

La aparición de resistencia a los compuestos antirretrovirales es el resultado de un balance entre la presión selectiva ejercida por los fármacos, la ausencia de actividad correctora de errores de la enzima transcriptasa reversa y el elevado ritmo de replicación del VIH-1. Estos fenómenos contribuyen a aumentar la variabilidad genética del VIH-1 y favorecen que en la población de virus de un mismo individuo existan genomas relacionados entre sí (quasiespecies). Uno de los problemas de la elevada variabilidad del VIH es que puede facilitar la aparición de mutaciones de resistencia (MR) de bajo nivel. Estas variantes minoritarias con MR son frecuentemente subestimadas por las técnicas de secuenciación poblacional, cuya sensibilidad no permite la detección de variantes representadas con una frecuencia inferior al 20-30 . Durante los últimos años se han ido desarrollando técnicas más sensibles para identificar variantes minoritarias del VIH-1. La importancia de su presencia es controverti da y está todavía por esclarecer, aunque existen evidencias suficientes para pensar que podrían tener importancia desde el punto de vista de la patogenia y la terapéutica de la infección. La aplicación de la técnica de secuenciación de genomas indivi duales (SGI) a muestras de plasma podría contribuir, en primer lugar, a aportar información sobre la presencia y evolución de las variantes minoritarias del VIH-1 con MR. Teniendo en cuenta además que todas las variantes circulantes podrían estar int egradas en forma de provirus, el análisis de células de sangre periférica mediante esta técnica, podría ser una herramienta útil para identificar todas las MR acontecidas a lo largo de la historia clínica del paciente. En este trabajo se describen n uevas aplicaciones de la SGI en diferentes áreas de la infección por VIH-1 y se presentan resultados que prueban la utilidad del estudio de la diversidad de secuencias del virus para el diagnóstico y el manejo de los pacientes infectados por VIH-1.