Caracterización estructural de nucleótidos por espectroscopia infrarroja y raman

Resumen

En este trabajo se caracteriza por espectroscopía infrarroja y Raman las estructuras Hoogsteen y Hoogsteen-reversa de bases nucleicas de guanina unidas por enlaces de hidrógeno. Como especies moleculares que contienen estas estructuras se han estudiado homodímeros GG de guanosina silanizada, heterotrímeros GGC de guanosina y citidina silanizadas y tetrámeros de guanosina y 18O(6)-guanosina. Este derivado isotópico se ha obtenido por primera vez mediante síntesis enzimática a partir de la 6-cloroguanosina. Los cálculos de frecuencias de vibración y el uso de derivados isotópicos demuestran por primera vez que existe un acoplamiento vibracional, de tipo electromagnético, entre los grupos carbonilo de dos bases de guanina unidas por enlaces de hidrógeno según la estructura Hoogsteen, pero no en la Hoogsteen-reversa. Esto origina perfiles espectrales característicos de estas estructuras en la región de 1750-1600 cm-1 que permiten distinguirlas cuando estén presentes en hélices polinucleotídicas. Finalmente, se han caracterizado estructuras conformacionales nucleosídicas C(3')-endo-anti y C(2')-endo-anti en mononucleótidos derivados de la inosina, que originan bandas Raman características en la región de 800-700 cm-1.