Controversias taxonómicas del género EdwardsiellaE. Tarda vs. E. Piscicida

  1. Buján Gómez, Noemí
Dirigée par:
  1. Alicia E. Toranzo Directeur/trice
  2. Beatriz Magariños Ferro Co-directeur/trice

Université de défendre: Universidade de Santiago de Compostela

Fecha de defensa: 30 novembre 2018

Jury:
  1. Juan Luis Barja Pérez President
  2. Aida Pitarch Secrétaire
  3. Manuel Romero Bernárdez Rapporteur

Type: Thèses

Résumé

El género Edwardsiella está compuesto por cinco especies, cuatro de ellas de gran importancia para la acuicultura debido a su implicación en varios brotes infecciosos. Este género empezó con la descripción de la especie E. tarda en la década de 1960, y luego con la descripción de las especies E. hoshinae y E. ictaluri a principios de los años ochenta. Más recientemente, se describieron las especies E. piscicida y E. anguillarum, en base a la reclasificación de aislados previamente identificados como E. tarda. Debido a la presencia de diferentes grupos genéticos dentro de la especie E. tarda y a la descripción de las nuevas especies, se llevaron a cabo estudios taxonómicos y genotípicos para esclarecer las controversias generadas. Aunque los resultados de AFLP y MLSA obtenidos mostraron que estas técnicas son buenas herramientas taxonómicas capaces de discernir entre las especies, solamente el MLSA resultó de utilidad para establecer relaciones entre los aislados y sus hospedadores o su origen geográfico. A pesar de estos resultados, la secuenciación del gen dnaJ fue la herramienta taxonómica más resolutiva. Para comprender la dispersión del género Edwardsiella, sus mecanismos de evolución y una posible especialización, se realizaron estudios genéticos poblacionales mediante MLST. Los resultados indicaron que la mutación es el evento evolutivo más común, aunque su repercusión en el proceso evolutivo general es la misma que la recombinación. Además, la población mostró una alta discontinuidad genética probablemente debido al alto número de mutaciones. Los factores de virulencia son importantes para conocer el mecanismo de infección en bacterias patógenas y, para desarrollar estrategias de prevención y tratamiento. Empleando las herramientas de proteómica comparativa, 2D-DIGE y TMT6plex, se identificaron varias proteínas relacionadas con el proceso de virulencia de E. piscicida. El análisis 2D-DIGE, mostró que proteínas como FliC, HtpG y ArnA, relacionadas con la resistencia a los antibióticos y/o los mecanismos de resistencia a las defensas del hospedador, forman parte del elenco de los factores de virulencia de E. piscicida. Mediante la comparación de los proteomas de E. pisicicida obtenidos en diferentes condiciones de crecimiento en las que se modifica la disponibilidad de hierro, se verificó que las proteínas relacionadas con la captación de hierro se sobreexpresan en condiciones restrictivas de este elemento.