Caracterización de interacciones inespecíficas DNA-ligando mediante modelos de unión cooperativa a una red monodimensional. Estudio particular de sistemas formados por uno y dos tipos de complejos

Resumen

SE HA ESTUDIADO LA INTERACCION CON EL DNA DE LIGANDOS ESTABILIZANTES Y DESESTABILIZANTES DESDE UN PUNTO DE VISTA SEMIEMPIRICO, UTILIZANDO EL METODO DE FUNCIONES GENERATRICES DE SECUENCIA Y LA DESNATURALIZACION TERMICA DE COMPLEJOS DNA-LIGANDO COMO TECNICA EXPERIMENTAL. MEDIANTE ESTE ESTUDIO SE HAN ENCONTRADO, PARA AMBOS TIPOS DE LIGANDOS, RELACIONES EXPLICITAS ENTRE LA TEMPERATURA DE TRANSICION Y LAS CONSTANTES DE ASOCIACION DEL LIGANDO AL DNA. A PARTIR DE ESTAS ECUACIONES, SE HA DESARROLLADO UN METODO QUE PERMITE OBTENER LOS VALORES DE DICHAS CONSTANTES DE ASOCIACION A PARTIR EXCLUSIVAMENTE DE LA INFORMACION CONTENIDA EN LAS CURVAS DE TRANSICION TERMICA DE COMPLEJOS DNA-LIGANDO. UTILIZANDO FUNDAMENTALMENTE LA MISMA METODOLOGIA SE HA ESTUDIADO UN SISTEMA MAS COMPLEJO: LA INTERACCION CON EL DNA DE LA HISTONA HL Y SU DOMINIO C-TERMINAL. LOS RESULTADOS EXPERIMENTALES PARECEN INDICAR QUE LA HISTONA HL PRESENTA SIMULTANEAMENTE DOS TIPOS DE INTERACCION CON EL DNA. CON EL FIN DE EXPLICAR ESTA FENOMENOLOGIA SE HA DESARROLLADO UN MODELO DE LA INTERACCION CON EL DNA DE UN LIGANDO QUE PRESENTA DOS TIPOS DE ASOCIACION, TANTO A NIVEL DE ISOTERMAS DE UNION COMO DE CURVAS DE TRANSICION TERMICA. ESTE MODELO PERMITE REPRODUCIR LOS RESULTADOS MAS RELEVANTES DE LAS CURVAS DE FUSION DE LOS COMPLEJOS HL-DNA Y ESTIMAR LOS VALORES DE LAS CONSTANTES DE LAS DOS INTERACCIONES QUE PRESENTA LA HISTONA HL. A PARTIR DE DICHO MODELO SE HA PODIDO SUGERIR TAMBIEN UN MECANISMO DE FORMACION DE DOS TIPOS DE COMPLEJOS HL-DNA, ASI COMO ESTABLECER LAS CARACTERISTICAS DE LA INTERACCION CON EL DNA DEL DOMINIO C-TERMINAL DE LA HISTONA HL.