Análisis de secuencias de proteínas orientado a la localización de dominios
- Sánchez Pulido, Luis
- Miguel Ángel Andrade Director
Defence university: Universidad Autónoma de Madrid
Fecha de defensa: 21 December 2005
- F. Montero Carnerero Chair
- Miguel Angel Alonso Lebrero Secretary
- Pablo Chacón Committee member
- Joaquín Dopazo Blázquez Committee member
- Ildefonso Cases Committee member
Type: Thesis
Abstract
El trabajo desarrollado en esta tesis trata sobre la disciplina del análisis de secuencias proteicas, con la intención de mostrar relaciones de homología entre ellas y la siguiente definición de dominios o regiones conservadas en alineamientos múltiples de proteinas. Permitiendo en esta forma el establecimiento de hipótesis de similitud funcional entre aquellas proteinas similares en secuencia. Aplicando el análisis de secuencias, el Segundo postulado del Método de Descartes : "Dividir cada una de las dificultades a examinar, en este caso secuencias de proteínas, en tantas partes (dominios)como sea posible y necesario para resolver mejor" [Descartes, 1637]. Aplicamos un abordaje metodológico común a los análisis de diferentes secuencias de proteinas con el objeto de identificar dominios a nivel dee secuencia, evaluando su conservación y distribución entre diferentes familias de proteínas. Con el propósito principal de racionalizar e interpretar la similitud de secuencias en términos funcionales comunes, tales como : interacciones con otras moléculas o proteínas, mecanismos de reacción y/o regulación coincidentes, etc. identificamos varios dominios en proteínas vinculadas a diversas enfermedades humanas, ofreciendo de éste modo nuevos puntos de vista para su posterior caracterización experimental.