Analysis of the molecular heterogeneity and disease evolution in chronic lymphocytic leukemia by combining high-throughput genomic and transcriptomic technologies

  1. HERNANDEZ SANCHEZ, MARIA
Supervised by:
  1. Jesús María Hernández Rivas Director
  2. M. Rocío Benito Sánchez Director
  3. Ana Eugenia Rodríguez Vicente Director

Defence university: Universidad de Salamanca

Fecha de defensa: 31 May 2017

Committee:
  1. María Araceli del Cañizo Fernández Roldán Chair
  2. Paola Dal Cin Secretary
  3. Antonio Cuneo Committee member

Type: Thesis

Teseo: 480255 DIALNET

Abstract

La leucemia linfática crónica (LLC) es un tipo de síndrome linfoproliferativo crónico que se caracteriza por la expansión clonal de linfocitos B clonales en sangre periférica durante al menos más de tres meses. Es una enfermedad heterogénea con gran variabilidad clínica. El curso de los pacientes puede ser desde muy indolente con una esperanza de vida cercana a la normal hasta una enfermedad que progresa rápidamente dirigiendo a una muerte temprana. Los análisis de secuenciación masiva a gran escala (NGS) han revelado una clara evidencia de la heterogeneidad genética entre pacientes que puede conducir el curso clínico variable de la enfermedad. En este sentido, el uso de técnicas moleculares de alto rendimiento puede contribuir a un mejor conocimiento de las bases moleculares que subyacen tras la heterogeneidad clínica en la LLC: 1. Los pacientes con LLC que tienen deleción de 13q (13q-) como única alteración citogenética mostraron un perfil de expresión de miRNA diferente atendiendo al número de células con 13q-. Así, los linfoticos B clonales de los pacientes con LLC y un alto número de pérdidas de 13q mostraron una infraexpresión del miR-143 y sobreexpresión del miR-155, lo que puede conducir a una menor apoptosis y mayor proliferación. Estos resultados aportan nuevos conocimientos sobre los mecanismos transcriptómicos que subyacen a la variabilidad en el curso clínico entre los pacientes con LLC y 13q- y mejoran nuestro entendimiento sobre el curso clínico desfavorable de los pacientes con LLC y alta carga de células 13q- 3. Los pacientes con deleción en 11q (11q-) representan un grupo heterogéneo y el número de células con esta alteración está relacionado con su pronóstico. Los pacientes con un bajo número de pérdidas en 11q (<40%) se caracterizan por mostrar una supervivencia global y un tiempo hasta el primer tratamiento mayor que los casos con un alto porcentaje de células 11q-. 4. Un número menor de pacientes con bajo porcentaje de células con pérdidas en 11q mostraron mutaciones genéticas comparado con el subgrupo de enfermos con un alto número de células 11q-. Diferencias clínicas observadas en este subgrupo de LLCs con 11q- podrían deberse a la heterogeneidad genética relacionada con el estado mutacional. 5. Un análisis integrativo de arrays de expresión génica y secuenciación masiva reveló sobreexpresión del gen TET2 en linfocitos B clonales en pacientes con LLC pero no se observaron mutaciones somáticas en las regiones codificantes de este gen, sugiriendo que el gen TET2 podría ser un nuevo candidato involucrado en la LLC. Estos datos sugieren que sería interesante profundizar en el conocimiento de la desregulación de TET2 en la LLC. 6. La secuenciación del exoma completo de muestras de LLC pareadas antes de recibir tratamiento mostraron una mayor heterogeneidad intratumoral en los pacientes con LLC con una enfermedad progresiva que los casos con una LLC clínicamente estable. La evolución de la enfermedad está acompañada de la aparición o selección de mutaciones drivers como las mutaciones de TP53, BIRC3 y CARD11, confirmando que la evolución clonal es un evento clave en la progresión de la LLC.