Simulacion de la interaccion entre derivados antitumorales de la naftalimida y bases nitrogenadas de acidos nucleicos mediante modelizacion molecular

Resumen

Se ha estudiado una serie de Naftalimidas substituidas (benzo-(de)-isoquinolein-1,3-dionas) ya que algunas tienen un elevado interés farmacológico por su extraordinaria acción inhibidora de la replicación celular. Pero se carecía de información estructural o de cálculos teóricos sobre ellos. Se ha propuesto y justificado un método, con un esfuerzo computacional razonable y a nivel de teoría suficiente, para calcular las energías de las estructuras y las conformaciones de las moléculas tanto aisladas como en disolución acuosa. Se han comparado los resultados obtenidos para la molécula base de la serie (Naftalimida) aplicando tanto un método semiempírico como varios métodos ab-initio. Para cada una de las tres naftalimidas más activas farmacológicamente, se han propuesto tres posibles conformaciones, calculándose la estructura de cada una tanto con el método propuesto como con uno ab-initio. Con ambos métodos se han calculado también las bases púricas y pirimidínicas del ADN. Se han comparado los resultados del método propuesto en el cálculo de estructuras, energías y cargas de Mulliken en las moléculas activas y diversas moléculas similares con iguales grupos amídicos y con sustituyente en el anillo en las posiciones 4,5 ó 6. Así mismo, se han calculado las energías de interacción entre derivados farmacológicamente activos y bases nitrogenadas del ADN, empleando el método propuesto, buscando reducir el número de disposiciones espaciales necesario. Los resultados estructurales se han clasificado según la conformación en tipos y clases de tipos, y según las posibilidades de puentes de H. En general, hay alejamiento de los anillos condensados de ambas moléculas, por giro o deslizamiento lateral, y formación de puentes de H, que además constituyen los puntos de mayor cercanía entre ambas moléculas o casi los más cercanos. Las interacciones de mínima energía se efectúan confrontando zonas estructurales muy determinadas de ambas moléculas de cada pareja, como puente de H corto en la distancia mínima entre ellas.