Aplicación de técnicas de qpcr para la cuantificación relativa de enterobacterias

Resum

La colonización por enterobacterias productoras de carbapenemasas (EPCs) durante el ingreso hospitalario es un problema creciente a nivel mundial. Aunque el proceso de colonización es silente, los portadores rectales de EPCs tienen un mayor riesgo de desarrollar infecciones por estas bacterias y por tanto es necesario contener su propagación en los hospitales. Para ello, se implantan medidas higiénicas, la detección de portadores asintomáticos mediante el cultivo de torundas rectales y en ocasiones estrategias de descolonización como los trasplantes fecales, el uso de antibióticos orales no absorbibles o la administración de probióticos. En la práctica habitual, los resultados de colonización o el éxito en la descolonización se expresan como un resultado dicotómico (positivo o negativo). En esta tesis planteamos estudiar la carga intestinal de Klebsiella pneumoniae productora de la carbapenemasa OXA-48 (KpOXA-48) en pacientes colonizados mediante el uso del método 2-ΔΔCt basado en qPCR. Este método nos ha permitido diferenciar aquellos pacientes en los que su microbiota ha sido totalmente desplazada por KpOXA-48 de aquellos en los que estas bacterias suponen una pequeña fracción del total de bacterias intestinales. Además, analizamos aquellos factores que pueden modificar la carga intestinal de estas bacterias y sus posibles consecuencias clínicas. Igualmente, hemos aplicado este método en un ensayo clínico piloto de descolonización rectal de enterobacterias productoras de carbapenemasa OXA-48 mediante la administración de probióticos y prebióticos para determinar los efectos del tratamiento más allá de la descolonización absoluta. Y finalmente abrimos la posibilidad de aplicar esta técnica en otros contextos como el seguimiento de la carga rectal de Serratia marcescens durante un brote en varias unidades de neonatos.