Principios termodinámicos de la formación de la hélice alfa papel en la estructura tridimensional, estabilidad y plegamiento de las proteínas

Resum

EN ESTA TESIS SE HA CONSTRUIDO POR PRIMERA VEZ UN MODELO CUANTITATIVO DE LA TRANSICION HELICE/OVILLO PARA HETEROPEPTIDOS. ESTE MODELO ES CAPAZ DE DESCRIBIR TODA LA INFORMACION EXPERIMENTAL CONOCIDA HAS TA LA FECHA. EL MODELO SE HA UTILIZADO COMO HERRAMIENTA CONCEPTUAL PARA ESTUDIAR EL PAPEL DE LA CAJA DE ENCAPUCHAMIENTO EN LA HELICE ALFA ASI COMO PARA DESCRIBIR UN NUEVO MOTIVO ESTRUCTURAL (LA GRAPA HIDROFOBICA) QUE ESTABILIZA LA HELICE ALFA, Y VALIDAR UN METODO PARA EL CALCULO DE LAS PROPENSIONES INSTRINSICAS. SEGUIDAMENTE SE HA ESTUDIADO CUALES SON LOS REQUERIMIENTOS MINIMOS DE PROPENSION DE HELICE ALFA PARA LA FORMACION DE UNA PROTEINA ALFA/BETA PARALELA MEDIANTE EL ANALISIS CONFORMACIONAL POR DICROISMO CIRCULAR Y RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR DE TODOS LOS PEPTIDOS CORRESPONDIENTES A LAS HELICES ALFA DE CINCO PROTEINAS PERTENECIENTES A ESA FAMILIA. POR ULTIMO, SE ESTUDIA EL PAPEL DE LAS PROPENSIONES DE HELICE ALFA EN LA ESTABILIDAD DE LAS PROTEINAS MEDIANTE LA MODIFICACION, CON NUESTRO MODELO, DE LAS PROPENSIONES DE HELICE ALFA DE CADA UNA DE LAS HELICES ALFA DE LA PROTEINA CHE Y, ESTUDIANDO EL EFECTO DE ESAS MUTACIONES EN LA ESTABILIDAD DE LA PROTEINA.