Caracterización estructural y funcional de la proteína de unión a DNA de cadena sencilla del bacteriófago ²29

Resumen

Estas tesis doctoral se planteó con el objetivo principal de esclarecer las bases moleculares del requerimiento de la proteína de unión a DNA de cadena sencilla del bacteriófago fi 29 durante la replicación del DNA viral. Para ello se analizaron las propiedades estructurales tanto de la proteína como del ssdna al que se une: Se determinaron los parámetros termodinámicos (afinidad, cooperatividad, entalpia; Entropía y tamaño del sitio de unión) que definen el complejo ssb-dna; Se analizaron nuevas funciones de esta ssb; Y se localizaron los residuos proteicos responsables del contacto con el ssdna y de las interacciones proteina-proteina que mantiene el complejo. El análisis comparativo de las propiedades estructurales y funcionales de la ssb del fago fi 29 con las de las pocas ssbs que pueden considerarse como bien caracterizadas, sugiere que la forma particular en la que esta proteína organiza las regiones de ssdna de los intermedios replicativos de fi 29, y la forma dinámica a la que se une a ellos, podría ser la responsable de su requerimiento funcional durante la replicación del DNA de este bacteriófago: Los resultados obtenidos en esta tesis, que se han incluido en nueve publicaciones hasta el momento de la defensa, han contribuido de modo importante al entendimiento del mecanismo que media la actuación funcional de la ssbs.