Métodos de simulación de dinámica brownianadesarrollo y aplicaciones

Abstract

Este trabajo contiene una primera aportacion de caracter metodologico, consistente en el desarrollo de metodos computaciones para la prediccion de propiedades dinamicas de macromoleculas en disolucion. Se ha puesto a punto programa (hydro) para el calculo de propiedades de estructura rigida, y otro (brow) para la simulacion de la dinamica browniana de macromoleculas con cierta flexibilidad. Una primera aplicacion ha consistido en simular las propiedades de cadenas macromoleculares flexibles en presencia de un campo electrico, mediante dinamica browniana. Se ha estudiado la deformacion y la birrefringencia inducidas por el campo, tanto en su aspecto estacionario como en version dinamica, dependiente del tiempo. El otro estudio en el que se ha aplicado nuestra metodologia concierne a la dinamica en disolucion de adn. Se ha simulado la difusion traslacional y la difusion rotacional perpendicular de fragmentos de 8-20 pares de base usando hydro para modelos doblehelicoidales rigidos, encontrandose buen acuerdo con los datos experimentales.