Diversidad de patógenos en aves silvestres neotropicalesestrategias de descubrimiento e identificación del papel de las especies hospedadoras

Resumen

Con esta tesis doctoral se pretende arrojar luz en el campo de los patógenos que circulan en la fauna silvestre, más en concreto, en las aves silvestres. En un contexto global en el que la transmisión de patógenos entre fauna silvestre, animales domésticos y humanos es mayor que nunca, los estudios con aproximaciones enfocadas al descubrimiento de nuevos patógenos en la fauna silvestre son esenciales para la salud humana, la conservación de especies o la ecología. Sin embargo, con algunas excepciones, pocos son los patógenos estudiados en aves silvestres. En nuestra investigación, nos hemos centrado en dos grupos importantes de patógenos que portan este grupo de animales: los virus y los hemosporidios, dos modelos que permiten diferentes perspectivas en el estudio de los patógenos de aves. Además, pretendemos resaltar el valor de las zonas remotas como fuente de nueva información en el ámbito de la diversidad de patógenos y de las aproximaciones enfocadas al descubrimiento como una herramienta esencial para su estudio. Para ello, muestreamos la comunidad de aves silvestres del sotobosque en un bosque tropical húmedo de la Reserva Natural de Nouragues (Guayana Francesa) y analizamos su viroma cloacal mediante secuenciación profunda y la comunidad de hemosporidios que los infectan utilizando las últimas técnicas de cribado molecular disponibles. Demostramos que, si miramos en hospedadores y regiones del planeta poco explorados, encontramos una nueva diversidad de patógenos y de relaciones con sus hospedadores. Estos resultados cambian el paradigma imperante sobre la distribución de patógenos entre los hospedadores tanto en el tiempo actual (los paseriformes pueden ser considerados hospedadores importantes de ciertos virus y parásitos) y en el tiempo evolutivo (el espectro filogenético y la diversidad de estructuras genómicas se hacen más amplios para los virus). El uso de nuevas técnicas mostró que la prevalencia de parásitos pudiera ser más alta de lo pensado, aunque estas técnicas no están exentas de problemas asociados. Además, mostramos cómo la malaria aviar afecta de forma desigual a los paseriformes de Nouragues, habiendo unas especies que concentran la mayoría de infecciones y otras que parecen evitar la infección. Con ello, ponemos de manifiesto la importancia de muestrear en hospedadores poco estudiados que habitan en zonas remotas como requisito indispensable para ampliar de forma sustancial el conocimiento disponible acerca de la diversidad de patógenos de las aves.