Aplicación de técnicas moleculares en la filogenia de aphyllophorales

Résumé

Se determinó un método para el diagnóstico molecular basado en las secuencias de ADNr, para la detección e identificación de hongos Basidiomycetes pudridores de madera. A partir de carpoforos y cultivos de 46 especies de basidiomicetos, se amplificó la región ITS, que comprende ITS1, 5.8S y ITS2, utilizando los cebadores ITS-1, ITS-4, ITS1-F y ITS4-B. Usando este método, es posible la detección e identificación de hongos pudridores en muy poco tiempo sin necesidad de recurrir a la taxonomía tradicional. %&/Para evaluar las relaciones filogenéticas del género Rigidoporus se secuenciaron las regiones de ITS del ADNr de 120 muestras de 22 especies de este género. El producto de la PCR fue clonado y secuenciado. Las secuencias fueron analizadas para conocer sus implicaciones taxonómicas y filogenéticas usando análisis de distancia, máxima parsimonia y Bayesiano. Las especies de Rigidoporus usadas en ente estudio fueron filogenéticamente heterogéneas. Estos análisis no sustentaron la monofilia del género. Sin embargo un grupo de especies representado por Rigidoporus incurvus, R. biokoensis, R. dextrinoides, R. microporus y otros están estrechamente relacionados en un mismo clado. Otras especies de Rigidoporus incluyendo R. undatus, R. lineatus, R. crocatus, R. vinctus no se incluyen en este grupo.